42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2087 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  95.33 
 
 		 108 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  88.79 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
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NC_010682  Rpic_3441  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  73.15 
 
 		 108 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3094  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  73.15 
 
 		 108 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5694  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  72.22 
 
 		 108 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_6225  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  69.44 
 
 		 108 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4718  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  69.9 
 
 		 104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  66.99 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1877  EthD  57.43 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  54.46 
 
 		 109 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  54.9 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
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NC_012792  Vapar_5978  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  52.43 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2708  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  47.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3870  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.93 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5139  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  46.08 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  hitchhiker  0.00632638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2223  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.12 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0608  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  47.12 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0177  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.14 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0881  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3112  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.86 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.16 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.69 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
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NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.78 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.14 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
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NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  41.18 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.55 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.55 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3681  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.59 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401382 
 
 
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NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.41 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.6 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4538  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  41.18 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3458  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.92 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0215  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.85 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587315 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6287  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.99 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2482  hypothetical protein  30.69 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6690  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_6455  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_0769  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 106 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
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