18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4209 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1310    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  33.14 
 
 
751 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  32.08 
 
 
711 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  28.96 
 
 
728 aa  126  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  34.11 
 
 
717 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  27.82 
 
 
820 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  35.06 
 
 
820 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  27.86 
 
 
741 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  27.39 
 
 
814 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  25.95 
 
 
919 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  26.47 
 
 
884 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  29.48 
 
 
835 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  24.96 
 
 
706 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  29.12 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1447  hypothetical protein  23.83 
 
 
733 aa  66.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  25.21 
 
 
713 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25.39 
 
 
706 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  25.82 
 
 
804 aa  44.3  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>