34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3458 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3458  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 100 aa  204  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.25 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3441  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3094  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5694  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.31 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  36.89 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4538  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.23 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6225  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2223  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.31 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.92 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.92 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.37 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.92 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.35 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.68 
 
 		 101 aa  57  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4718  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.13 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5139  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.32 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  hitchhiker  0.00632638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.68 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  38.3 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1877  EthD  30.39 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5978  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.1 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3681  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  29.41 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3112  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.77 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0608  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.11 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2708  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.47 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0177  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.74 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.77 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3870  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>