18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3350 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 338 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  64.2 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.23 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 		 347 aa  323  4e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00933652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.99 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0205  hypothetical protein  26.02 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.41 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.04 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1646  putative dehydratase  27.04 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  35.56 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>