28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2740 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  47.21 
 
 
210 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  38 
 
 
188 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  35.94 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  35.81 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  38.76 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  43.8 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  33.86 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  32.86 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  32.29 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  32.46 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  30.57 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  29.76 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  34.32 
 
 
254 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  45.16 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  34.27 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  36.84 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  29.08 
 
 
166 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  33.16 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  31.79 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  29.81 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  36.8 
 
 
165 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25080  hypothetical protein  31.98 
 
 
278 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  29.1 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  30.82 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  31.62 
 
 
185 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  30.57 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>