16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1208 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  976    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  42.24 
 
 
574 aa  183  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  36.82 
 
 
507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  39.89 
 
 
538 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  31.85 
 
 
558 aa  146  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  33.62 
 
 
577 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1859  hypothetical protein  44.27 
 
 
623 aa  133  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.163853  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  32.97 
 
 
560 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  29.13 
 
 
489 aa  87.4  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  33.5 
 
 
601 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  34.6 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  33.44 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  26.94 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0759  hypothetical protein  30.23 
 
 
513 aa  53.5  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.13019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  27.14 
 
 
582 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3763  hypothetical protein  29.87 
 
 
582 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>