22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0456 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  100 
 
 
604 aa  1148    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  41.69 
 
 
641 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  34.77 
 
 
596 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  34.96 
 
 
647 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  34.21 
 
 
624 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  35.38 
 
 
612 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  35.8 
 
 
617 aa  237  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  35.84 
 
 
619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  33.46 
 
 
566 aa  207  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  30 
 
 
585 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  28.44 
 
 
585 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  31.91 
 
 
587 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  29.53 
 
 
584 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  27.84 
 
 
716 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  29.75 
 
 
618 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  37.54 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  28.92 
 
 
588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  28.92 
 
 
588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  28.94 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  29.52 
 
 
642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
925 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  28.22 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>