15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6521 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1188  hypothetical protein  54.64 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1631  hypothetical protein  55.1 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000804863  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  43.36 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  42.24 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  51.81 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  43.59 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  40.87 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  40.87 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  36.14 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  38.03 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  38.03 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  38.03 
 
 		 301 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1491  hypothetical protein  28.92 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00141449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>