16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3763 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3763  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4237  hypothetical protein  98.29 
 
 
117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257801  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4013  hypothetical protein  69.7 
 
 
116 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4354  hypothetical protein  69.7 
 
 
116 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6000  hypothetical protein  66.67 
 
 
116 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1666  hypothetical protein  60.68 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0340303  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0455  hypothetical protein  51.52 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1328  hypothetical protein  52.87 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2754  hypothetical protein  52.87 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2612  hypothetical protein  52.87 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0159  hypothetical protein  52.87 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1021  hypothetical protein  52.87 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1142  hypothetical protein  45.83 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71833  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0185  hypothetical protein  51.81 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5568  hypothetical protein  47.37 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1858  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>