21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2830 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1664  hypothetical protein  64.95 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3020  fimbrial subunit  39.96 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37010  fimbrial subunit CupA4  38.51 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59750  fimbrial subunit  36.83 
 
 		 448 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000441836  hitchhiker  2.5403100000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0297  fimbrial subunit  34.68 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0168  hypothetical protein  37.83 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0500  hypothetical protein  37.83 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.5659  decreased coverage  0.000668779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4045  hypothetical protein  37.83 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246264  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0390  putative fimbrial usher  33.7 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.097978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0368  putative fimbrial usher  33.41 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.584072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0370  putative fimbrial usher  33.26 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0377  putative fimbrial usher  33.04 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898506  normal  0.223329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0430  putative fimbrial usher  33.04 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278902  hitchhiker  0.000289263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2166  hypothetical protein  32.81 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0114121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2107  hypothetical protein  32.81 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2275  hypothetical protein  32.66 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0256688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0301  fimbrial subunit  32.27 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0295  hypothetical protein  30.63 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1273  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2008  putative fimbriae; usher  34.94 
 
 		 174 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.446551  normal  0.112656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>