20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0365 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0365  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00871372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0381  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3547  hypothetical protein  95.52 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.366269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2650  hypothetical protein  94.03 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0457  hypothetical protein  94.03 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0432  hypothetical protein  92.54 
 
 
67 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0327024  hitchhiker  0.00000000136233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0350  hypothetical protein  89.55 
 
 
67 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0942  hypothetical protein  46.97 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0618  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2351  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0850  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1052  hypothetical protein  41.27 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396719  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1815  hypothetical protein  41.27 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1137  hypothetical protein  45.31 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1202  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2613  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3386  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2425  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0341  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139131  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6003  hypothetical protein  38.33 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>