12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6288 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6288  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262335  normal  0.0206583 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6574  hypothetical protein  97.74 
 
 		 133 aa  227  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  80.45 
 
 		 1004 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6537  hypothetical protein  87.22 
 
 		 133 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5500  hypothetical protein  78.2 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0769  hypothetical protein  58.49 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00282822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0781  hypothetical protein  58.49 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000646713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2029  hypothetical protein  34.92 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2186  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0337771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0457  hypothetical protein  28.69 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0082  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0238826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5488  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.271258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>