17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5306 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  94.92 
 
 		 219 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  79.19 
 
 		 197 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  79.19 
 
 		 197 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  79.19 
 
 		 197 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  75.13 
 
 		 197 aa  297  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  48.45 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  36.79 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  46.02 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  38.86 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  40.8 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  39.43 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  37.36 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  32.53 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  58.82 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1128  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00652499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>