16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4237 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4237  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257801  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3763  hypothetical protein  98.29 
 
 
117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4013  hypothetical protein  70.71 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4354  hypothetical protein  70.71 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6000  hypothetical protein  67.68 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1666  hypothetical protein  59.83 
 
 
131 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0340303  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0455  hypothetical protein  52.53 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1328  hypothetical protein  54.02 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2754  hypothetical protein  54.02 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2612  hypothetical protein  54.02 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0159  hypothetical protein  54.02 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1021  hypothetical protein  54.02 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1142  hypothetical protein  47.92 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71833  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0185  hypothetical protein  53.01 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1858  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5568  hypothetical protein  48 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>