12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3563 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3563  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134432  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5404  hypothetical protein  87.61 
 
 		 237 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4705  hypothetical protein  82.53 
 
 		 243 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3658  hypothetical protein  82.53 
 
 		 243 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0370725  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3863  hypothetical protein  82.48 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2450  hypothetical protein  87.5 
 
 		 193 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5049  hypothetical protein  82.67 
 
 		 209 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.256189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4803  hypothetical protein  54.01 
 
 		 207 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100222  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0053  hypothetical protein  57.45 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.498454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4988  hypothetical protein  54.01 
 
 		 207 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0855  hypothetical protein  51.06 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3581  hypothetical protein  46.33 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>