18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2298 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2298  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5715  hypothetical protein  97.74 
 
 
133 aa  256  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1777  hypothetical protein  95.49 
 
 
133 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2434  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  229  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2394  hypothetical protein  96.67 
 
 
120 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.957561  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2389  hypothetical protein  95.83 
 
 
120 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0901  hypothetical protein  95.83 
 
 
120 aa  220  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4471  hypothetical protein  58.27 
 
 
107 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3981  hypothetical protein  56.69 
 
 
107 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7068  hypothetical protein  45.97 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3016.1  hypothetical protein  75 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1110  hypothetical protein  75.51 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1555  hypothetical protein  73.47 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.913168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1116  hypothetical protein  73.47 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0972  hypothetical protein  73.47 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3040  hypothetical protein  76.92 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3714  hypothetical protein  35.79 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7094  hypothetical protein  36.56 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>