15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2004 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0432  secretion-associated protein  98.85 
 
 		 414 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2004  secretion-associated protein  100 
 
 		 349 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1912  putative secretion-associated protein  98.28 
 
 		 349 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0672  secretion-associated protein  41.52 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2274  putative type III secretion apparatus protein  41.52 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2192  putative type III secretion apparatus protein  41.52 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0758  serine protease  41.55 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5925  putative type III secretion apparatus protein  35.31 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0473  secretion-associated protein  33.33 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5864  sctD; secretion-associated protein  32.48 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5647  SctD; secretion-associated protein  32.19 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0177431 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1960  type III secretion inner membrane protein  46.72 
 
 		 125 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1961  transmembrane protein  42.31 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0857  HRPW transmembrane protein  28.11 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0240135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03409  HrpD5  27.42 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>