18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1128 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A1033  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  320  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1128  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  319  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4182  hypothetical protein  81.65 
 
 
156 aa  236  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1156  hypothetical protein  38.94 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0053  hypothetical protein  40.91 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0705  hypothetical protein  38.6 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0323976  normal  0.180125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0694  hypothetical protein  37.72 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236825  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0668  hypothetical protein  36.79 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.307794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6519  hypothetical protein  39.22 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1696  hypothetical protein  36.11 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.0319054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1122  hypothetical protein  36.04 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0268  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6733  hypothetical protein  37.74 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3586  hypothetical protein  28.44 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0381  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256376  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0349  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.379699  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0777  hypothetical protein  31.73 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0287  hypothetical protein  32.41 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>