15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0998 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  819    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  65.98 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  29.95 
 
 
412 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  29.68 
 
 
411 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  29.44 
 
 
403 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  26.85 
 
 
408 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  27.21 
 
 
395 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  27.69 
 
 
377 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  29.37 
 
 
384 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  26.26 
 
 
379 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  25.06 
 
 
372 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  30.8 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  27.31 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3556  hypothetical protein  23.56 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4386  hypothetical protein  23.56 
 
 
494 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>