14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0011 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  420  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0009  hypothetical protein  99.5 
 
 
202 aa  417  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  73.89 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  48.45 
 
 
198 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2942  protein of unknown function DUF922  51.15 
 
 
223 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164247  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  48.5 
 
 
192 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5905  hypothetical protein  42.56 
 
 
216 aa  167  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  44.38 
 
 
202 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  21.26 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  30.53 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  23.98 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  24.56 
 
 
208 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  24.1 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  25.29 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>