23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1375 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  89.71 
 
 		 243 aa  437  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  67.66 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 256 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  29.28 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  26.64 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  28.38 
 
 		 238 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 244 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  26.24 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  25.34 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  26.01 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  24.41 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>