17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1028 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  98.48 
 
 		 197 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  82.44 
 
 		 206 aa  360  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  40.98 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  43 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  42.02 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  41.49 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  44.07 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  25.57 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  28.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  27.51 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  18.92 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  24.02 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  21.79 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  21.91 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  24.12 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0009  hypothetical protein  24.64 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>