17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0670 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  89.41 
 
 		 85 aa  157  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1167  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1015  hypothetical protein  51.76 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737954  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  45.98 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1464  hypothetical protein  49.41 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0961  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  34.18 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  32.91 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  34.21 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  31.25 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  32.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  31.34 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  26.58 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>