14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1961 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1961  transmembrane protein  100 
 
 		 207 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0672  secretion-associated protein  100 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2274  putative type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2192  putative type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0758  serine protease  90.34 
 
 		 335 aa  322  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5647  SctD; secretion-associated protein  42.08 
 
 		 361 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0177431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5864  sctD; secretion-associated protein  41.75 
 
 		 346 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5925  putative type III secretion apparatus protein  41.67 
 
 		 338 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2004  secretion-associated protein  40.39 
 
 		 349 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1912  putative secretion-associated protein  39.91 
 
 		 349 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0432  secretion-associated protein  39.91 
 
 		 414 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0473  secretion-associated protein  36.3 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03409  HrpD5  33.33 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0857  HRPW transmembrane protein  32.11 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0240135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>