23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0838 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1199    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  98.46 
 
 
585 aa  1181    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  26.63 
 
 
716 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  27.52 
 
 
617 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  27.9 
 
 
647 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  27.48 
 
 
604 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  26.3 
 
 
612 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  26.96 
 
 
624 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  25.53 
 
 
596 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  28.19 
 
 
566 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  25.09 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  26.29 
 
 
587 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  25.98 
 
 
618 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  27.54 
 
 
619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  27.61 
 
 
641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  25.88 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  24.06 
 
 
642 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  26.61 
 
 
588 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  26.61 
 
 
588 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  26.32 
 
 
588 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  23.82 
 
 
572 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 
925 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0500  Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  23.79 
 
 
213 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>