31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7428 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  67.39 
 
 
92 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  67.78 
 
 
95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  65.93 
 
 
92 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  64.77 
 
 
92 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  61.45 
 
 
100 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  60.92 
 
 
90 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  63.75 
 
 
99 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  61.54 
 
 
87 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  60.26 
 
 
87 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  58.23 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  56.1 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  53.33 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  58.97 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  58.97 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  56.41 
 
 
88 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  57.14 
 
 
87 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  52.33 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  52.33 
 
 
91 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  52 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  49.37 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  53.25 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  53.25 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  54.79 
 
 
88 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  51.9 
 
 
88 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  52.7 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  53.85 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  51.32 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  51.95 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  44.3 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>