20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6879 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6879  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0994967  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4145  hypothetical protein  58.22 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3510  hypothetical protein  57.27 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.26644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2715  hypothetical protein  57.42 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1814  hypothetical protein  54.93 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4749  hypothetical protein  50.22 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1313  hypothetical protein  52.73 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2809  hypothetical protein  40.64 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555734  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0976  hypothetical protein  42.93 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0915  hypothetical protein  42.93 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1382  hypothetical protein  41.95 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.42725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3370  hypothetical protein  40.38 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3672  hypothetical protein  38.25 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0858  hypothetical protein  28.42 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0399112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  26.73 
 
 		 968 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2228  hypothetical protein  26.73 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2380  hypothetical protein  24.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  25.48 
 
 		 989 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1006 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3433  hypothetical protein  24.39 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>