13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6584 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  35.03 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  32.32 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  32.37 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  32.35 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  36.07 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  26.9 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  26.9 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  26.9 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  35.19 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>