17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5910 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  70.77 
 
 		 195 aa  284  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  53.61 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  51.5 
 
 		 202 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  48.47 
 
 		 196 aa  201  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  49.74 
 
 		 202 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  46.53 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  47.15 
 
 		 275 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  43.88 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  43.88 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  38.25 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  33.15 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  32.97 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  30.22 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01360  hypothetical protein  27.32 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  24.07 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>