15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4307 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4307  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3676  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3471  hypothetical protein  32.82 
 
 
170 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1408  hypothetical protein  30.07 
 
 
183 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1537  hypothetical protein  32.5 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.756577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4170  hypothetical protein  34.33 
 
 
150 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140359  normal  0.0812529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2660  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0132  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225286  normal  0.0233456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0133  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0118  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0718  hypothetical protein  27.56 
 
 
147 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.86375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0576  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0730  hypothetical protein  32.22 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0390  putative membrane protein of unknown function  29.59 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1484  hypothetical protein  32.22 
 
 
169 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>