20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3399 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  43.01 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  54.35 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  54.55 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  48 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  40 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  40 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  40 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  61.29 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0736  hypothetical protein  54 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0526  hypothetical protein  35.37 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  40.82 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>