24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3037 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  49.69 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  61.45 
 
 		 111 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  51.81 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  51.25 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  49.32 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  49.33 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  41.43 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  50.59 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  47.76 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  47.95 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  43.06 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  41.79 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  48.15 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  54.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  57.14 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  50.79 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  47.62 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  46.03 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  37.31 
 
 		 126 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  45.45 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  47.06 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>