18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2103 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2103  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0466  protein of unknown function DUF1688  59.95 
 
 
418 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2717  protein of unknown function DUF1688  52.62 
 
 
418 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.970888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3986  hypothetical protein  50.98 
 
 
434 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2975  hypothetical protein  52.61 
 
 
417 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0496469  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4220  protein of unknown function DUF1688  51.23 
 
 
432 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1964  hypothetical protein  48.24 
 
 
438 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2167  hypothetical protein  43.56 
 
 
427 aa  358  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3258  hypothetical protein  53.47 
 
 
405 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4571  hypothetical protein  50.49 
 
 
435 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  hitchhiker  0.00903491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2195  hypothetical protein  42.82 
 
 
427 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0314  hypothetical protein  48.91 
 
 
442 aa  346  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5191  hypothetical protein  51.12 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5280  hypothetical protein  51.12 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5572  hypothetical protein  51.12 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2662  protein of unknown function DUF1688  49.62 
 
 
471 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0729613  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00820  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
436 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08797  conserved fungal protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09640)  38.41 
 
 
480 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.199708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>