32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1486 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  79.55 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  72.41 
 
 		 92 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  67.78 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  63.04 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  63.1 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  65 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  52.33 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  57.89 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  54.43 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  50.62 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  56.58 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  58.9 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  59.72 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  53.75 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  51.19 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  54.43 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  56.58 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  49.4 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  56.58 
 
 		 87 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  49.37 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  53.95 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  53.95 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  53.95 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  47.37 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  42.68 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  35.06 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>