13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1211 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1211  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  331  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.299542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3794  colicin V production protein  52.05 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  30.1 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  28.16 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  30.54 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  30.69 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  21.57 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  27.17 
 
 		 232 aa  44.3  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  27.89 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  28.18 
 
 		 183 aa  42  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  26.53 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  28.16 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  28.16 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>