13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0484 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0484  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.173769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  68.16 
 
 		 232 aa  263  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  30.53 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  25.52 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  27.98 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  27.98 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  27.55 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  24.46 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0328  hypothetical protein  24.6 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2067  hypothetical protein  24.6 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0220632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  24.74 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  27.32 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4924  hypothetical protein  25.4 
 
 		 266 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>