17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  70.59 
 
 
84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  67.06 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  63.75 
 
 
85 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  64.71 
 
 
84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  62.5 
 
 
85 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  66.22 
 
 
84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  64.86 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  64.86 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  64.86 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  62.5 
 
 
83 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  43.06 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  34.15 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  36.9 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  46.88 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  34.85 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>