23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44250  acyl-carrier protein  100 
 
 
87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02853  conserved hypothetical protein  48.78 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3262  putative acyl carrier protein  48.78 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0716  phosphopantetheine-binding  48.78 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3444  putative acyl carrier protein  48.78 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3157  putative acyl carrier protein  48.78 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  44.44 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3075  acyl carrier protein  50.79 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117369  normal  0.374768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3899  hypothetical protein  34.62 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3422  phosphopantetheine-binding  36.92 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1686  phosphopantetheine-binding  48 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  37.93 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  37.93 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2768  phosphopantetheine-binding  37.1 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5432  acyl carrier protein, putative  41.82 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  34.48 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3110  hypothetical protein  31.43 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2170  hypothetical protein  31.34 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  36.21 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  36.21 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  36.21 
 
 
103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2687  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161716  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  36.21 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>