16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_37550  holin-like protein  100 
 
 		 110 aa  223  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3950  phage holin  44.23 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1559  phage holin  39.62 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3884  phage holin  38.68 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  hitchhiker  0.00338957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1064  phage holin, lambda family  32.04 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2820  phage holin, lambda family  32.04 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1401  phage holin, lambda family  32.04 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3416  holin  32.11 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1217  phage holin  23 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10029  cell lysis protein  29.17 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00833852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0303  phage holin  29.17 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0630  phage holin, lambda family  28.16 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000535579  normal  0.0759671 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00727  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00764215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2333  hypothetical protein  26.05 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0986383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1215  hypothetical protein  30.93 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0685  phage holin, lambda family  27.18 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000460271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>