54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  53.69 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  52.71 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  52.22 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  54.29 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  53.88 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  56.16 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  50.25 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  51.23 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  50.25 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  49.75 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.56 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  31.06 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  30.67 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  30.67 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.14 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  29.94 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  30.43 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  26.9 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  33.1 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  32 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.13 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  28.29 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.49 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  28.67 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  29.53 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  28.93 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.5 
 
 		 172 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  30.54 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  29.27 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  27.95 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  27.52 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  23.13 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  28.87 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  29.56 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  29.56 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.77 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  29.94 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.77 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.77 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  29.94 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0565  hypothetical protein  25.56 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  26.95 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  29.61 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0575  hypothetical protein  27.42 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000903438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0480  hypothetical protein  26.88 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.52 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  29.38 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>