14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04350  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4557  hypothetical protein  52.98 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5363  hypothetical protein  45.51 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5271  hypothetical protein  45.51 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5142  hypothetical protein  42.51 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5413  hypothetical protein  46.62 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911887  normal  0.141138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5078  hypothetical protein  41.42 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5529  hypothetical protein  44.52 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5664  hypothetical protein  41.03 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0398  hypothetical protein  32.42 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4187  hypothetical protein  31.35 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.431269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3569  hypothetical protein  32.74 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2072  hypothetical protein  28.16 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0524  hypothetical protein  20.93 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>