11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5905 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5905  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2942  protein of unknown function DUF922  59.9 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  56.25 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  55.36 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  53.37 
 
 		 202 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  42.56 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0009  hypothetical protein  42.05 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  26.4 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  27.81 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  24.78 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>