18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2964 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  48.11 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  42.78 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  41.62 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  43.18 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  46.02 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  39.89 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  40.11 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  44.89 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  43.1 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  43.1 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  43.1 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  37.14 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  40.54 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  32.11 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  67.92 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  29.08 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1465  hypothetical protein  30.9 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>