14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2245 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  48.8 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  47.96 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  47.45 
 
 		 208 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  45.36 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  43.17 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  39.41 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  44.07 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  20.67 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  23.96 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  22.4 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  22.45 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  23.49 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  25.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>