15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0777 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0777  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  251  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0349  hypothetical protein  79.34 
 
 		 121 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.379699  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0381  hypothetical protein  79.34 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0287  hypothetical protein  61.54 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0268  hypothetical protein  37.14 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0668  hypothetical protein  37.37 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.307794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0694  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0705  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0323976  normal  0.180125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1122  hypothetical protein  31.96 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1128  hypothetical protein  31.73 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1033  hypothetical protein  31.73 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1696  hypothetical protein  30.3 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.0319054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6519  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4182  hypothetical protein  32.04 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>