61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0267 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4124  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  61.44 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4438  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  65.49 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2196  phosphonate metabolism PhnG  57.62 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901708  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4235  phosphonate metabolism PhnG  61.27 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3825  phosphonate metabolism PhnG  51.77 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.413231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4089  phosphonate metabolism PhnG  49.65 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220517  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3703  phosphonate metabolism PhnG  48.94 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3857  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  55.32 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.921004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1286  phosphonate metabolism PhnG  48.94 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  54.78 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1316  phosphonate metabolism PhnG  46.21 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5848  PhnG protein  48.94 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2914  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  53.33 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0813  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  45.32 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.73842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3328  alkylphosphonate utilization protein PhnG  45.77 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2559  phosphonate metabolism protein PhnG  40.91 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0145  phosphonate metabolism PhnG  42.22 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2886  phosphonate metabolism PhnG  38.22 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0521  phosphonate metabolism PhnG  40.69 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1308  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  38.36 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00253415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2694  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  38.73 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0305  phosphonate metabolism PhnG  37.32 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.282377  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20360  putative phosphonate metabolism protein PhnG  40.4 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.357176  normal  0.656556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4207  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  46.98 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3694  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.77 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2251  phosphonate metabolism PhnG  39.22 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101673  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3560  phosphonate metabolism protein PhnG  36.13 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1749  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  40.4 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148039  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4782  phosphonate metabolism PhnG  43.71 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286403  normal  0.339522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0887  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  38.03 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0575  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.91 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4342  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  37.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  36.67 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3925  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.67 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03933  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4567  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.67 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5614  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.67 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6098  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  48.28 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4603  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36.67 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4655  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3890  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  36 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3773  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  46.67 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0479  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  34.27 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4186  alkylphosphonate utilization protein PhnG  41.26 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2179  putative phosphonate metabolism protein PhnG  50 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.118129 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1177  phosphonate metabolism protein PhnG  39.18 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2586  phosphonate metabolism protein PhnG  39.18 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2400  alkylphosphonate utilization operon protein PhnG  39.18 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0316  phosphonate metabolism protein PhnG  39.18 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3345  phosphonate metabolism protein PhnG  39.18 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3356  alkylphosphonate utilization operon protein PhnG  38.51 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0766  phosphonate metabolism protein PhnG  40 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2924  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  44.35 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3311  phosphonate metabolism protein PhnG  37.8 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5940  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  47.2 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2957  putative phosphonate metabolism PhnG protein  42.38 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0242964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2278  phosphonate metabolism protein PhnG  35.46 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.454708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1925  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  35.46 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.447942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2911  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0228  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  35.85 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.347019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>