18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4495 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  276  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  67.48 
 
 
125 aa  173  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  37.1 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  35.25 
 
 
268 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  35.94 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  36.89 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  33.87 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  33.58 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  33.6 
 
 
196 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  38.32 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  29.06 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  33.06 
 
 
259 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  30.58 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  33.96 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  27.69 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  29.63 
 
 
151 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>