16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1826 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1826  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  373  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433146  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  30.2 
 
 
163 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  28.66 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  31.82 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  23.81 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  21.15 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  32 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  29.79 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  32.31 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  32.31 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  26.76 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  25.17 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  33.85 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  30.63 
 
 
221 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  25.52 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  23.53 
 
 
175 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>