29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0441 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  40.73 
 
 
316 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  41.04 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  39.74 
 
 
309 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  31.17 
 
 
320 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30 
 
 
306 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  28.15 
 
 
456 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  23.79 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  26.02 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  25.36 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  24.47 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  27.86 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  26.22 
 
 
369 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  26.22 
 
 
374 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  26.52 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  25.77 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  25.52 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29 
 
 
366 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25 
 
 
350 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  24.07 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  28.99 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  27.44 
 
 
339 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  27.27 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  26.92 
 
 
334 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  23.66 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.27 
 
 
359 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  26.59 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>