27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6793 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  73.91 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  70.59 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  67.14 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  64.29 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  64.71 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  62.86 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  63.49 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  67.27 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  63.49 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  61.02 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  61.02 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  61.02 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  56.06 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  56.06 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  58.33 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  51.56 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  58.49 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  54.1 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  51.43 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  63.08 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  56.52 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  47.27 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>